Ngày 08/07/2008, lễ công bố quyết định kiện toàn các Bộ môn thuộc Khoa Thủy văn – Tài nguyên nước và Khoa Công trình long trọng diễn ra tại Hội trường 123 – Đại học Thủy lợi. Các quyết định của Hiệu trưởng đã được công bố bao gồm:
*Tổ chức lại các Bộ môn thuộc Khoa Thủy văn và Tài nguyên nước thành các Bộ môn mới như sau:
1. Bộ môn Kỹ thuật sông và Quản lý thiên tai
2. Bộ môn Thủy văn và Tài nguyên nước
3. Bộ môn Mô hình toán và Dự báo Khí tượng Thủy văn
*Thành lập Bộ môn Công trình Giao thông thuộc Khoa Công trình. Bộ môn Công trình Giao thông phụ trách chương trình Đào tạo Công trình Giao thông
* Thành lập Bộ môn Xây dựng Dân dụng và Công nghiệp thuộc Khoa Công trình. Bộ môn Xây dựng Dân dụng và Công nghiệp phụ trách chương trình đào tạo Xây dựng Dân dụng và Công nghiệp.
*Kiện toàn tên gọi các Bộ môn thuộc Khoa Công trình
- Bộ môn Thủy công
- Bộ môn Sức bền kết cấu
- Bộ môn Kết cấu Công trình
- Bộ môn Vật liệu xây dựng
- Bộ môn Công nghệ và Quản lý xây dựng ( Thi công cũ)
- Bộ môn Địa Kỹ thuật ( Địa chất – Nền móng cũ)
- Bộ môn Công trình Giao thông ( Thành lập mới)
- Bộ môn Xây dựng Dân dụng và Công nghiệp ( Thành lập mới)
Theo PGS.TS Nguyễn Quang Kim – Hiệu trưởng Nhà trường, đây tuy là trọng trách nặng nề nhưng cũng là cơ hội phát triển của các Khoa nói riêng và Nhà trường nói chung, trên tinh thần Chiến lược phát triển trường giai đoạn 2006 – 2020.